Не совсем понятно, старый ДДУ в итоге зарегистрирован или нет? Если да, то можно внести изменения в планировку и стоимость квартиры путем подписания доп соглашения. А вот если расторгать старый, то тогда это регистрация расторжения, заключение нового ДДУ, зачет денег, причем частичный и реальный возврат разницы... очень путанно. Мне кажется лучше вернуть деньги, учитывая еще тот факт, что квартиры, которая в Вашем ДДУ получается не существует и им наверно проще вернуть деньги, чем потом иметь проблемы при сдаче дома.