Ирина, квартира получена в наследство. Смерть в 2015 году. Продана за 3 млн. в этом году. Покупаю за 5 млн, готовую.

Светлана, если Вы ранее не использовали налоговый вычет на покупку квартиры, а право собственности на новую квартиру зарегистрируете в этом году, то расчет по налогу у Вас будет такой:
3 млна - налогооблагаемая база. В соответствии с нормами ст. 220 НК РФ Вы имеете право уменьшить налогооблагаемую базу на стандартный налоговый вычет в размере 1млна рублей. Остается 2млна, на которые Вы должны будете уплатить налог 13% = 260тыс.р. Но за приобретение новой квартиры Вам от государства положен еще один налоговый вычет (на покупку). его максимальный размер 2млна*13%, т.е. те же 260тыс.р.
В итоге получается, что Вы должны государству за продажу наследственной квартиры налог 260 тыс. р., но и государство должно Вам за покупку другой квартиры такую же точно сумму.
При правильно заполненной декларации можно сделать взаимозачет, т.е. погасить свой долг по НДФЛ за продажу суммой полагающегося Вам за покупку вычета.
А чтобы сделать все грамотно и чтобы налоговый "комар" носа не подточил, рекомендую Вам декларацию, которую надо будет подать в следующем году, составить с помощью грамотного бухгалтера или аудитора.

Спасибо, все понятно.

Пример: если вы купили квартиру в 2016 году за 5 млн и продаете её ранее 5 лет за те же 5 млн, но её кадастровая стоимость - 10 млн, то налоги облагается база будет: 7 млн (70% КС) - 5 млн (цена покупки) = 2 млн.

Светлана, Вы неправильно понимаете суть вычета. Ваш расход на другую квартиру зачтется в полном объеме, когда Вы будете продавать эту самую ДРУГУЮ квартиру. К продаже первой квартиры этот расход отношения не имеет. По этому расходу можно только получить налоговый вычет на покупку в размере 260 000р. и этой суммой погасить налог за продажу первой квартиры. Нет дохода - это когда купил квартиру за какую-то сумму и ЭТУ ЖЕ квартиру продал за такую же сумму. Но Вы первую квартиру не покупали, а получили по наследству, т.е. расходов на ее приобретение не понесли.