Продажв квартиры менее 3-х лет в собственности.

Здравствуйте.

1) Это еще нужно доказать. Если Вы квартиру покупали в строящемся доме и в ДДУ (ЖСК) было бы прописано, что квартира куплена без отделки, то тогда было бы всё просто. Если Вы покупали готовую квартиру с ремонтом, то не вернут.
2) Есть понятие налогового периода. Если Вы продаёте в 2014 г., то декларацию нужно подать до 30 апреля 2015г. Если продаете в 2015г., то декларацию нужно подать до 30 апреля 2016г.
3) Занизить стоимость в ДКП (при продаже Вашей квартиры) до 3500тр.

Есть комментарии к ст 220 НК РФ. Почитайте их.

Если Вы сможете ДОКУМЕНТАЛЬНО подтвердить затраты на ремонт в размере 500 тыс. руб., и налоговая эти документы примет (признает надлежащим образом оформленными и суммы надлежащим образом подтвержденными), То в декларации Вы сможете заявить вычет на все 4 млн. руб. Если же часть или все расходы налоговая не признает - с этой суммы придется платить налог.
Для того, чтобы была возможность уменьшить налоговую базу за счет вычета при покупке - обе сделки должны быть совершены в одном налоговом периоде...

Уволитесь, но работать продолжите, в другом городе? Или выходите на пенсию?
Если пенсия http://www. mk. ru/daily/hotnews/article/2013/07/07/880331-pensio neram-razyasnili-tonkosti-polucheniya-nalogovogo-v yicheta. html

Если так уж принципиально для сделки указать в договоре 4000т.р., а не заниженную до 3500 сумму, то заявляете по месту прописки свое право на получение налогового вычета за покупку в 2013 году квартиры. Вам полагается возврат подоходного налога 13% от суммы ее покупки, но не более 260 000руб. А при ее продаже возникает обязанность по уплате НДФЛ в размере 13% от пятисот тысяч, что равно 65 000 рублей. Этот долг по налогу взаимозачетом гасится из указанных 260 000 рублей, а оставшиеся 195 000 Вы сможете получить в виде возврата Вам НДФЛ, если платите 13% налог на доходы от какой-либо деятельности (например: работаета, сдача имущества в аренду и т.п.)
Если же укажете 3500, то налога не будет.
Ремонт в Вашей ситуации "к делу не пришьёшь", увы...))
Декларацию надо подать в любом случае. В случае с зачетом её лучше составлять с помощью независимого профессионала.

Для нашей налоговой инспекции важна документарность.
Вы купили в 13 за 3500, в 15 будете продавать за 4000. Итого - 500 т.р. разницы, которые облагаются по ставке 13%. Все понесённые расходы на улучшения должны быть доказуемы документарно, как и сказал Руслан.
И, конечно, если не использован налоговый вычет, то вы можете им воспользоваться.

с 500 тыс рублей возникает налог в размере 13%.

Все верно Вам Руслан подсказал.
1. Продав за 4 м.р. у Вас будет налог: (4-3,5)*13%
2. Для большинства случаев купить нужно именно в том налоговом периоде, в котором получен доход, т.е. в 2014г.

Хельга, у Вас еще в 2013 г. возникло право на получение вычета при покупке, если ранее оно Вами не реализовано. Поэтому вопрос продавать в 14 покупать в 15 для Вас совершенно не актуален. Вы уже сейчас можете использовать взаимозачет по налогам.