Здравствуйте, Александр! Отличие этих квартир только в документах, на основании которых оформлено право собственности. У кооперативной - справка о выплаченном пае, у приватизированной - договор передачи. Сама же сделка по оформлению купли-продажи таких квартир проходит абсолютно одинаково.
Кооперативная квартира - квартира, приобретенная на возмездной основе (купленная за деньги). Приватизированная - оформлена в собственность в результате БЕСПЛАТНОЙ передачи от государства. Требования к документам на оформление купли-продажи одинаковые. Разница только в правоустанавливающих документах.
Существенной разницы в данной ситуации нет.