Уважаемый Александр!
1) Доли детей в новом жилье не должны быть меньшей площади, чем были в продаваемой квартире, а также рыночные стоимости проданных/купленных долей должны быть равноценны. Опека "смотрит" на всё, кроме юридической чистоты приобретаемой квартиры! к сожалению! И очень желательно Вам такую проверку провести.
Занижение реальной цены в договоре купли-продажи - существенная "мина" Вашей сделки, продавец совершает налоговое правонарушение, а Вы ему способствуете. В случае признания ДКП недействительным, Вы вернете квартиру и получите обратно 1 млн.руб, Кроме того, Вы не сможете воспользоваться в полном объеме правом на имущественный вычет при покупке, т.е .вернуть часть уплаченного Вами в бюджет НДФЛ (за детей тоже положен вычет).
Не советую оформлять квартиру только на детей, хоть 1/100, а на себя оформляйте.
2) Если Ваш продавец не утратил право на имущественный вычет при покупке и купит жилье в том же году, что и продал, он сможет минимизировать или свести налог к уплате к нулю. Это большой вопрос, здесь много нюансов и тонкостей, в идеале, чтобы он лично получил ответ в налоговой инспекции или у налогового консультанта.

реально
будет

1. Реальна, но лучше уточнять в опеке.
2. Если покажет 5 м.р., то заплатит (5-1)*13%
Если право на вычет при покупке ранее им не реализовано и при соблюдении других немаловажных условий... в конечном счете его налог будет таким: (5 м.р.-1 м.р.)*13% - 260 т.р.

Метраж на детей не должен быть меньше предыдущей площади ( така как они собственники)‌‌‌

Вам верно подсказали насчет рисков по покупке квартире с "занижением" цены договора купли-продажи. Налоговая достаточно часто проводит проверки по таким сделкам. Скорее всего, даже кадастровая стоимость данной квартиры будет выше одного миллиона рублей. В этом случае при проведении налоговой проверки налог может быть исчислен исходя из размера кадастровой стоимости квартиры. Может быть лучше стоит проговорить с продавцом и выяснить, не собирается ли он покупать недвижимость в текущем налоговом периоде (текущий год), ведь тогда он возможно сможет указать в договоре реальную стоимость.

Налог не возникнет: ваша квартира в собственности более 3 лет, так что налог не возникнет, даже если вы совсем ничего не купите, не беспокойтесь.
С точки зрения органов опеки, главное - площадь. По-крайней мере, так - в нашем территориальном органе. Вообще, опека- организация очень и очень специфичная, и там много зависит от конкретного специалиста, с которым будете работать. Я бы советовал обратиться туда самим за консультацией.
На первый взгляд, проблем быть не должно, но тем не менее.