Светлана, вы физическое лицо, и внесли собственнику? Правильно? А вы уверенны что он собственник квартиры? Подробней опишите ситуацию.

Банки требуют не вносить аванс, а сделать первоначальный взнос в коком-то размере (15-80%). И этот первоначальный взнос, так же как и кредитные средства могут быть заложены в банковскую ячейку с условием доступа.

Тогда описывайте ситуацию правильно - это позволит получить более правильный ответ.
Сначала говорите одно, потом выясняется, что вы покупаете на кредитные средства. Деньги внесли, договор подписали, теперь, как я уже сказал: ждите и надейтесь на положительный исход. На будущее - внимательно читайте все, что подписываете, особенно финансовые документы.
С этим вопросом вам стоило обратиться ДО подписания. Если бы взяли 1 день на изучение авансового договора - никто бы не был против, тем более, что это - комната, и не думаю, что на ее покупку выстроилась километровая очередь. И тогда бы вам здесь и посоветовали бы как правильно действовать, и спали бы сейчас спокойно.
А на каком этапе сделка у вас сейчас?

Нет, такого аванса(20%) требует банк-кредитор, так как я беру целевой кредит на покупку конкретного жилья. А потом гасить этот кредит буду материнским капиталом

за квартиру обычно вносят 30 тыс, а вас за комнату "развели" на 150 - был повод задуматься.
интересно, куда смотрел ваш риэлтор?

Да, остаётся надеяться, что сделка состоится, но опасения у меня есть, и сумма аванса (по необходимости) для меня большая.

Не факт. А что тогда оставили взамен? Возможно, продавца насторожил двойной размер, хотя, по закону, если бы оформляли договор задатка, а не аванса, то так и есть - продавец возвращает задаток в двойном размере.
Вот представьте себе ситуацию, что продавец отказывается, или по его вине сделка не состоится, на основании чего теперь он должен будет вам вернуть аванс? Представили? Нет у него оснований. А что мешало эту же ситуацию представить до подписания договора и внесения денег? Я не собираюсь вас учить уму-разуму, вы уже взрослый человек.
Давите на своего риэлтора и требуйте подписания дополнительного соглашения к договору аванса, в котором будут прописаны условия, что вы получаете свой аванс обратно в случае отказа продавца от сделки.
Либо как-то еще, неважно. Коллеги может быть подскажут другие варианты. Если продавец намерен выходить на сделку и продать вам квартиру, то его это не смутит. Пусть не в двухкратном размере, но в однократном - обязательно, чтобы вы свои денги смогли получить обратно.

С согласия риелтора и по прозьбе продавца был удалён пункт, где было сказано, что если продавец отказывается от сделки, то он платит двойной аванс покупателю. Получается, что они в сговоре?

Что тут сказать? Поблагодарите своего риелтора (если есть) за внимательность и надейтесь на то, что сделка состоится.

В договоре написано, что внесён аванс за конкретную квартиру, остальная часть уплачивается после подписания основного договора.