Регистрация права по квартире - 2 т.р.
Регистрация права по доле:
а) Иванов собственник, Петров и Сидоров покупают одновременно по 1/2 доли. Петров и Сидоров платят по 1 т.р.
б) Иванов - покупатель, Петров 1/2 и Сидоров 1/2. Петров продает Иванову свою 1/2. В таком случае Иванов платит 2 т.р.

Официально это звучит так.
За государственную регистрацию доли в праве общей долевой собственности, возникновение которой не связано с первоначальной государственной регистрацией прав на объект недвижимого имущества, уплачивается государственная пошлина каждым физическим лицом в размере 2 т.р.

За государственную регистрацию доли в праве общей собственности, возникающем с момента государственной регистрации прав, государственная пошлина уплачивается в размере, определенном пп. 22 п. 1 ст. 333.33 НК РФ, умноженном на размер доли в праве собственности, на основании п. 2 ст. 333.18 НК РФ.

Спасибо.
А переплата может быть основанием для приостановки со стороны госреестра не знаете?

Повторяю, свой ответ: В Вашем случае происходит регистрация права по 2 объектам. Если обмен идет целой квартиры на долю, то у приобретателя целой квартиры сумма пошлины будет - 2000 руб, а у приобретателя доли в квартире - сумма равная его доли от 2000 р.

Вы меня, наверное, не поняли. В собственность одного человека переходит квартира, а в собственность другого - доля в общей долевой собственности другой квартиры. Регистрируется 2 права собственности.

2000 р. - общая сумма гос. пошлины за регистрацию права. В случае приобретения объекта в долевую собственность, сумма разделяется между приобретателями согласно долям.
В Вашем случае происходит регистрация права по 2 объектам. Если обмен идет целой квартиры на долю, то у приобретателя целой квартиры сумма пошлины будет - 2000 руб, а у приобретателя доли в квартире - сумма равная его доли от 2000 р.