Приобретение квартиры физлицом у юрлица

самое просто - купля продажа конечно. Дарение - вряд ли будет Вам выгодно. Но если Вам неинтересен простой подход, можете попробовать подойти с другой стороны. Устав ООО должен содержать условия выхода соучредителей из ооо, нужные для следующего. Вы, как соучредитель выходите из ООО и забираете в качестве своей доли квартиру. Нужные документы об этом делает ООО, и регистрируете ее на себя. При этом потом учитывая семейный бизнес вернуться в ооо Вам никто, наверное, не помешает.

"Переоформляя" недвижимость с ЮЛ на ФЛ надо ПРАВИЛЬНО посчитать сумму, которую Вы укажите в ДКП, чтобы не было вопросов по налогам к ЮЛ - я надеюсь, что сумма будет не 1 млн.рублей?
Что касается дарения, то с налоговой точки зрения - это самый плохой вариант для ЮЛ и для Вас, поскольку придется Вам заплатить подоходный налог

Добрый день Ирина! Я рекомендовала бы вам договор-купли продажи, он более прозрачен и налоговые ожидания более адекватные, нежели чем при дарении. Дарение возможно, но здесь совершенно четко встанет вопрос о налоговой базе.
Относительно затрат, здесь надо понимать цену и от нее уже рассчитывать налог, рекомендую Вам обратиться в налоговую по вашему месту жительству и нахождению ООО для более полного и достоверного ответа .