Как не резиденту продать квартиру с минимальными потерями?

Это не супруги и в ЕГРН числятся ДВА владельца, так что ничего мать одна продать не может, пока долю на нее не переоформят. Чтобы не платить налогов, в этой ситуации есть только один путь: разделить собственность на доли, а потом долю сына подарить матери. Продавать надо в следующем году. В 183 дня матери зачтутся все дни ее пребывания в РФ в 2018 году - и до, и после продажи.
Доверенность по заграну сделать можно. Делать доверку надо на третье лицо и выгоднее заверить одну доверенность с полномочиями и на раздел долей, и на последующее дарение доли сына матери. Настоятельно рекомендую пойти к нотариусу того региона, где находится квартира, и сделать для консульства образец доверенности, заплатив за тех. работу. В консульствах очень часто делают такие доверенности, которые потом приходится переделывать.

Так если сына мало волнует эта квартира, может и не заморачиваться с налогами;)

Из вопроса можно предположить, что мать – гражданка РФ, тогда проживание в течение установленного срока упрощается и можно будет действовать как резидент. Далее, уточняем все-таки собственность совместная или долевая.
1. Если совместная, то мать может продать квартиру самостоятельно, согласие сособственников предполагается/презюмируется. Можно дополнительно оформить нотариальное согласие сына для спокойствия покупателя. Тогда налога не возникает.
2. Если собственность долевая, то сын может свою долю матери подарить, оформив доверенность на третье лицо (нотариальная сделка по отчуждению долей). Далее мать продает квартиру как единственный собственник, при соблюдении резиденства налогов не возникнет.

Раз речь идет о совместной собственности матери и сына, то наверняка приватизация была более 20-ти лет назад, т.е. собственность более 3-х лет.
Если мать приедет и станет резидентом, то налога у нее не будет. Оптимизации налогов сына, при условии, что приезжать в РФ он не планирует, может основываться только на занижении реальной стоимости его доли. Другой вариант - дарение его доли матери. В таком случае у нее будет приращение ранее возникшего права и налога опять же не будет.
ВАЖНО. Даже, если мать приедет завтра, то налоговым резидентом ей уже не стать, не успеет. Следовательно, вопросы продажи и оптимизации налогов сейчас не сопоставимы.