когда квартира переходить в собственность

Есть риск, что вам откажут в субсидии, тк дду будет виден в Росреестре.
А право собственности возникает с момент государственной регистрации, те когда будет подписан передаточный акт с застройщиком и вы подадите на регистрацию в РР

Откажут, как только вы обратитесь в жилищный департамент. При оформлении субсидии, запросят выписку из ЕГРН, где указано, чем вы владеете - вот и будет видно всё.
Любая покупка недвижимости регистрируется в Росреестре. Как вы это скроете?

Увидят сразу, по заключению ДДУ, задолго до получения собственности. Рискуете.

Право собственности участника долевого строительства на объект долевого строительства возникает после передачи участнику долевого строительства объекта и подлежит государственной регистрации в Росреестре, с момента регистрации права Вы имеете в собственности квартиру.
"наша семья должна получить субсидию на улучшение жилищных условий" -- почему бы не дождаться этого счастливого момента и не использовать средства на приобретение готовой квартиры в новом доме???