Если дочь Ваша несовершеннолетняя, то не получится, т.к. продажа между несовершеннолетней внучкой и бабушкой запрещена законом.
По налогам:
Если квартира досталась бабушке по безвозмездной сделке, то по действующему законодательству наплог 13% надо будет платить с суммы продажи, уменьшенной на один миллион.
Если по возмездной сделке досталась, то вместо миллиона можно вычесть из суммы продажи сумму, по которой бабушка приобрела квартиру, а с положительной разницы будет налог 13%.

На разные года можно. Но ипотека не пройдет. Они долю не кредитуют.

Налоговый вычет в 1 млн. предоставляется каждый раз при продаже недвижимости? Можно сделку разделить на 2 части - на 2014 и 2015 гг?

они ипотеку на доплату собираются брать - кто ж им даст при равноценности обмена. И вообще, не думаю, что на мену дают ипотеку - банку эта заморочка не нужна. Не вижу вариантов, кроме продажи за два миллиона. А если ипотеку хотите получить все два миллиона, то возможно еще и больше в договоре придется указывать, т.к. кроме ипотечных, должны быть собственные средства - смотря какой банк.
А бабушка, если родство с внучкой не видно из документов невооруженным глазом, сможет скомпенсировать налог вычетом на покупку ваших долей. Вам сопровождение сделки необходимо, как мне думается.

По договору мены я не смогу получить ипотеку и налог на доходы будет начислен со всей стоимости квартиры- это 6млн.минус 1млн

Делайте договор мены, в договоре укажите, что считаете обмен равноценным. Как раз сей час этим занимаемся, только в нашем случае сложность еще в том, что регионы разные. При договоре мены точно в один налоговый период попадете, да и вообще, налоговая такие мены "пропускает".

Нужно смотреть на основании каких документов ей принадлежит квартира: если приватизация, наследство, дарение, то налог 13 % от суммы превышающий 1 млн. рублей. Если квартиру покупали, то все зависит от стоимости, указанной в договоре купли-продажи. Налог будет начисляться с суммы превышающей стоимость квартиры, указанной в договоре купли-продажи по которому она покупала квартиру. Например, она покупала квартиру за 1,5 млн. рублей, а Вам продаст за 2 млн., налог будет начисляться с 500 тыс. рублей.

Претензий не будет.
В зависимости от способа организации Вашей сделки налог может быть:
а) 130 т.р.
или
б) нулевой, для этого способа необходимо поторопиться, здесь очень важен налоговый период.

Все зависит от знаний тонкостей налогового законодательства и умения применять эти знания на практике.
Если необходима помощь обращайтесь, контакты на моей страничке.

Поняла, спс., дочь совершеннолетняя, буду брать ипотеку, но она предлагает еще вариант, можете подсказать какой выгоднее, тогда опишу и нужна будет помощь профессионалов?

Досталась в порядке наследования. Мы ей отдаем свои доли в др. ее квартире и получаем отдельную квартиру с нашей доплатой в 2 млн.р. Налоговой базой будет 1 млн.?