Если Вы показываете аренду в отчетности по ИП, а не снимаете эту квартиру просто для своего проживания, то Вы являетесь налоговым агентом арендодателя со всеми вытекающими последствиями. НДФЛ арендодателя должны оплачивать Вы.

сейчас не угадаешь как поступить, но банку-то виднее

Если показываете при расчете "расходов" аренду и используете помещение в предпринимательской деятельности, а судя по тому, что Вы написали, так и есть, то - ДА. Ст. 226 НК РФ Вам в помощь) "Российские организации, индивидуальные предприниматели, нотариусы, занимающиеся частной практикой, адвокаты, учредившие адвокатские кабинеты, а также обособленные подразделения иностранных организаций в Российской Федерации, от которых или в результате отношений с которыми налогоплательщик получил доходы, указанные в пункте 2 настоящей статьи, обязаны исчислить, удержать у налогоплательщика и уплатить сумму налога...Указанные в абзаце первом настоящего пункта лица именуются в настоящей главе налоговыми агентами.", ну а дальше сами почитаете.