В соответствии с целевой программой "Расселение коммунальных квартир в Санкт-Петербурге" средства субсидии могут быть использованы на приобретение квартиры на вторичном рынке жилья, ЖИЛОГО ДОМА и др. объектов (ДДУ, ЖСК, уступка права.. при степени готовности дома более 70%...).При этом, жилое помещение может находиться на территории Санкт-Петербурга или Ленинградской области и иметь размеры не менее установленных для расселения.
Таким образом, по тексту Программы, субсидия может быть использована на приобретение дома в СНТ, если этот дом признан в установленном порядке жилым. Можно предположить, что дополнительным требованием на использование субсидии будет наличие "прописки" в этом доме у собственника, который Вам его продаст(это - с гарантией) или соответствующая возможность для Вас после покупки дома.
О реальном отношении к этому вопросу Администрации СПб надо интересоваться у них.

Занимаясь в основном домами, хочу посоветовать не рассматривать покупку дома на сельхозке. Второе и очень важное- сумму ДКП необходимо разделить на две части дом и земучасток, причём средства субсидии нужно полностью включить в дом, а землю покупать за собственные средства. Такие сделки лучше проводить под руководством подготовленного специалиста.

В законе чётко прописано нельзя приобретать жилую недвижимость на землях с/х за счёт государственной, бюджетной поддержки гражданина. Дачные дома/жилые порою размещаются на землях поселений вот на таких участках можно приобретать дом за счёт господдержки

Вам все равно отдавать документы по дому на согласование в Жилкомитет. Там предварительно и уточните по конкретному дому, тем более думается собственник не откажет предоставить ксерокопии для этого дела.

У Вас должна быть памятка и там все должно быть написано