Покупка квартиры с землёйю

Это КВАРТИРА. Земля тут не при чем

Так квартира это и есть часть дома...!

Потому что Вы купили квартиру, а не часть дома

НДС?! Может НДФЛ?
Вычет предоставляется... "имущественный налоговый вычет в размере фактически произведенных налогоплательщиком расходов на новое строительство либо приобретение на территории Российской Федерации жилых домов, квартир, комнат или доли (долей) в них, приобретение земельных участков или доли (долей) в них, предоставленных для индивидуального жилищного строительства, и земельных участков или доли (долей) в них, на которых расположены приобретаемые жилые дома или доля (доли) в них". Если Ваша покупка соответствует сказанному выше, то "почему так" уточняйте в своей налоговой инспекции. Вычет Вы имеете право получить в рамках всех произведенных расходов, как на участок, так и на 1/2 доли жилого помещения.

Вычет на приобретение имущества предоставляется по расходам на новое строительство или приобретение на территории РФ объекта жилой недвижимости (долей в них), земельных участков под них.
Вычет по покупке жилья не применяется в следующих случаях:
если оплата строительства (приобретения) жилья произведена за счёт средств работодателей или иных лиц, средств материнского (семейного) капитала, а также за счёт бюджетных средств;
если сделка купли-продажи заключена с гражданином, являющимся по отношению к налогоплательщику взаимозависимым.
Взаимозависимыми лицами признаются: физическое лицо, его супруг (супруга), родители (в том числе усыновители), дети (в том числе усыновленные), полнородные и неполнородные братья и сестры, опекун (попечитель) и подопечный (ст. 105.1 НК РФ).